大豆是我国重要的经济作物。近年来,黄淮海地区大豆“症青”现象频发,主要症状表现为品种应成熟时,植株仍然叶绿、枝青,有荚但荚而不实或者籽粒瘪烂的现象,严重影响大豆产量,威胁粮食安全。点蜂缘蝽被认为是导致大豆“症青”现象发生的重要原因,它通过刺吸植物汁液导致植株发育不良,危害严重时全株坏死,颗粒无收,防治点蜂缘蝽可以有效控制大豆“症青”的发生。
2021年6月18日,宁波大学植物病毒学研究所陈剑平院士团队在《MolecularEcology Resources》上发表了题为Chromosome-level genome assembly of the bean bugRiptortus pedestris的研究论文,为点蜂缘蝽的基因组学研究及生物防治提供了关键的资源。
研究采用三代PacBio测序技术结合二代基因组数据,通过Hi-C辅助基因组组装,最终获得1.080 Gb点蜂缘蝽全基因组,包括6组染色体和19,026个编码基因。进一步利用雌雄虫二代重测序数据并结合细胞学观察,确定点蜂缘蝽性别决定为XO型(即雄虫有13条染色体,雌虫有14条染色体),6组染色体中最短的为性染色体。研究详细测定了点蜂缘蝽消化道、表皮、脂肪体、肌肉、精巢、卵巢等6个组织以及37个不同发育阶段的转录组,确定18745个基因在不同组织或发育阶段转录,为未来点蜂缘蝽的研究及防控提供重要的参考数据库。

点蜂缘蝽全基因组概图
宁波大学省部共建“农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室”为该论文第一作者单位,黄海剑博士和叶雨轩博士为该论文的第一作者,陈剑平院士、李俊敏研究员、孙宗涛研究员和张传溪教授为通讯作者,叶庄新、闫箫天、王鑫和魏中艳也参与了研究,该研究得到了转基因生物新品种培育重大专项(2019ZX08004-004)等项目的资助。